Fra Ivan Karlić redoviti je profesor u trajnom zvanju na Katoličkom bogoslovnom fakultetu Sveučilišta u Zagrebu, pročelnik je Katedre za dogmatsku teologiju i Hrvatskoga mariološkog instituta KBF-a.

Predaje kolegije: „Kristologija“, „Sakramenti“ te seminare, različite obvezatne i izborne kolegije na diplomskom i poslijediplomskom studiju KBF-a.

Bio je voditelj znanstveno-istraživačkog projekta „Lik blažene Djevice Marije u franjevačkom propovjedništvu XVIII. st.“, zatim „Franjevački velikani“, „Mariološko marijanska tradicija u kontekstu suvremene hrvatske i europske tradicije“, „Filozofija i teologija (religija) u kontekstu znanstveno tehničke civilizacije“, „Oproštenje i pomirenje. Utjecaj mimetičke teorije Renéa Girarda na oproštenje i pomirenje među žrtvama nasilja“ te na drugim projektima.

Do sada je objavio trinaest knjiga, preko šezdeset znanstvenih članaka te više stručnih i publicističkih članaka. Organizirao je razne skupove te sudjelovao i održao mnogo pozvanih predavanja na međunarodnim i domaćim znanstvenim simpozijima i skupovima.

Osim knjiga, znanstvene radove uglavnom objavljuje u časopisima: Bogoslovska smotra, Crkva u svijetu, Obnovljeni život, Filozofska istraživanja i Nova prisutnost te u raznim Zbornicima radova.“

Dobitnik je Državne nagrade za znanost za 2022. godinu, za knjigu „Bogočovjek Isus Krist – 2. Mesija, Sin Božji i Spasitelj“.